生物显微镜的观察方式一般分为：案场观察、明场观察、荧光观察、相差观察和偏光观察五种

生物显微镜是主要用来测量计量方面的一类显微镜，与一般显微镜的不同主要在工作台的运行精度非常高，配有一些特殊的目镜，用于平面乃至三维数据的测量。采用物镜朝上的设计以便从标本的下方进行观察，因此被广泛地应用于生物实验室，用于查看培养细胞的生长状态等。

生物显微镜是一款采用多种模块化的部件包括人机工程学观察筒、载物台等的显微镜，能够适合各种应用的需要。它的观察方式一般分为五种：

①暗场观察

从低倍到高倍的暗场观察效果，选用从10X到100X的干式暗场聚光镜或从20X到100X的油式聚光镜。

②明场观察

图像更明亮，所有倍率都能够获得更高超的分辨率和平坦性，提供多种聚光镜，包括摇摆式聚光镜，适合从1.25X到100X的观察使用；低倍聚光镜能满足2X到100X(干镜)连续观察；消色差球差聚光镜减少了色差的产生；专门用语超低放大倍率的特殊聚光镜。请在使用125X物镜进行数字成像时选用超低倍聚光镜。

③荧光观察

该设备将荧光观察带到了一个崭新的高度，可以选择两种型号的反射荧光照明器，包括万能反射照明器和编码荧光照明器。总共能够安装多达8个荧光滤色镜组，适合FISH等多色荧光观察。高性能的滤色片能够使荧光观察更加高效、明亮和均匀。

④相差观察

高反差、高分辨率成像，高反差的相差图像能够近距离观察到细胞内部和或细菌。使用系列物镜，从10X到100X都能够进行相差观察。使用相差/暗场聚光镜，用户可以观察标本的明场暗场、相差或暗场效果。这些物镜也可以同时用于观察反射荧光成像。

⑤偏光观察

双折射结构的高分辨率成像，牙齿、骨骼、肌肉组织、神经组织、激动球蛋白纤维和有丝分裂的纺锤体无需染色都能够观察到。中间附件用于正像镜检和正像/锥光镜检。通过各种补偿器能够观察到广泛的光程差，同时可以选配专为偏光观察设计的聚光镜、物镜转盘、旋转载物台、物镜、简易偏光附件和检测尿晶体的检偏镜等。